ПЦР-тест-система для определения видов азотофиксаторов.
|
Даты проведения с 2020-06-05 по 2021-12-02 |
Методы и алгоритмы: для подбора праймеров мы использовали базу данных NCBI BLAST и программу UGENE. Для апробации и дальнейшей визуализации полученных результатов использовали метод ПЦР и гельэлектрофореза. Проводили оптимизацию по температуре отжига. Результаты: Праймеры на Azotobacter chroococcum сработали не специфично – амплификация проходила на представителях разных родов, хотя и получался фрагмент разной длины. Праймеры на Azotobacter vinelandii сработали специфично, то есть ПЦР проходила только на ДНК, выделенной из Azotobacter vinelandii. Праймеры для Enterobacter работали на всех представителях как семейства Azotobacteriaceae, так и семейства Enterobacteriaceae. Заключение: из трех праймеров корректно сработали только праймеры на Azotobacter vinelandii, в других случаях требуются доработка или использование других методов (например, рестрикционный анализ)
Проект опубликовал
